B.9 Lake Whatcom Electronic Data

The annual Lake Whatcom reports include a CD containing historic Hydrolab and water quality data (1988–2002); Austin Creek, Anderson Creek, and Smith Creek hydrograph data (1998-2002); historic plankton data (1991–2002); and historic storm water treatment monitoring data (1994–2002). The data files included on the CD are described in the readme.txt file on the CD.

The electronic data files have NOT been censored to identify below detection and above detection values. Refer to Tables 2 and 38 (pages § and §) for applicable detection limits and abbreviations. It is essential that any statistical or analytical results that are generated using these data be reviewed by someone familiar with statistical uncertainty associated with uncensored data.

Readme.txt:
⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆  
README FILE - LAKE WHATCOM DATA  
⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆  
The CD included with this report included the following data files:  
 
Hydrolab data        Water quality data         Hydrograph data  
1988˘hl.dat          1988˘wq.dat                WY1998.dat  
1989˘hl.dat          1989˘wq.dat                WY1999.dat  
1990˘hl.dat          1990˘wq.dat                WY2000.dat  
1991˘hl.dat          1991˘wq.dat                WY2001.dat  
1992˘hl.dat          1992˘wq.dat                WY2002.dat (current)  
1993˘hl.dat          1993˘wq.dat  
1994˘hl.dat          1994˘wq.dat  
1995˘hl.dat          1995˘wq.dat                Plankton data  
1996˘hl.dat          1996˘wq.dat                plankton.dat  
1997˘hl.dat          1997˘wq.dat  
1998˘hl.dat          1998˘wq.dat  
1999˘hl.dat          1999˘wq.dat                Storm water treatment data  
2000˘hl.dat          2000˘wq.dat                comps.dat  
2001˘hl.dat          2001˘wq.dat                grab.dat  
2002˘hl.dat          2002˘wq.dat  
 
The hydrolab data files contain the following variables: site, depth  
(m), month, day, year, temperature (C), pH, conductivity (uS/cm),  
dissolved oxygen (mg/L), lab conductivity quality control data  
(uS/cm), and secchi depth (m).  
 
The water quality data files contain the following variables: site,  
depth (m), month, day, year, alkalinity (mg/L), turbidity (NTU),  
ammonia (ug-N/L), total persulfate nitrogen (ug-N/L), nitrate/nitrite  
(ug-N/L), soluble reactive phosphate (ug-P/L), total phosphorus  
(ug-P/L), chlorophyll (mg/m3).  
 
The hydrograph data file contains the following variables: month, day,  
year, hour, min, sec, ander.g (ft), ander.cfs, austin.g (ft),  
austin.cfs, smith.g (ft), and smith.cfs  
 
The plankton data file contains the following variables: site depth  
month day year zooplankton (#/L), chrysophyta (#/L), cyanophyta (#/L),  
chlorophyta (#/L), phyrrophyta (#/L).  
 
The storm water treatment composite data file (comps.dat) contains the  
following variables: site, startmonth, endmonth, startday, endday,  
year, total suspended solids (mg/L), total organic carbon (mg/L),  
total nitrogen (mg/L), total phosphorus (mg/L), and AmTest data for 33  
total metals analyses (mg/L for aluminum, antimony, arsenic, boron,  
barium, beryllium, calcium, cadmium, cobalt, chromium, copper, iron,  
mercury, potassium, lithium, magnesium, manganese, molybdenum, sodium,  
nickel, phosphorus, lead, sulfur, selenium, silicon, silver, tin,  
strontium, titanium. thallium, vanadium, yttrium, zinc).  
 
The storm water treatment grab data file (grab.dat) contains the  
following variables: site, sample (A-D, in order of collection),  
month, day, year, time (am/pm), temperature (C), pH, dissolved oxygen  
(mg/L), conductivity (uS/cm), total coliforms (cuf/100 mL), fecal  
coliforms (cfu/100 mL), and enterococcus (cuf/100 mL).  Beginning in  
2002, total coliforms and enterococcus analyses will be discontinued  
and {\em E.~coli} will be added.  
 
 
The site codes in the data are as follows:  
    11  = Lake Whatcom Site 1  
    21  = Lake Whatcom Intake site  
    22  = Lake Whatcom Site 2  
    31  = Lake Whatcom Site 3  
    32  = Lake Whatcom Site 4  
    33  = Strawberry Sill site S1 (discontinued)  
    34  = Strawberry Sill site S2  
    35  = Strawberry Sill site S3 (discontinued)  
 
    BW1 (BW˘in)    = Brentwood wet pond inlet  
    BW2 (BW˘out)   = Brentwood wet pond outlet  
    PP1 (PP˘cell1) =  Park Place wet pond cell 1 (discontinued)  
    PP2 (PP˘cell2) = Park Place wet pond cell 2 (discontinued)  
    PP3 (PP˘cell3) = Park Place wet pond cell 3 (discontinued)  
    PP4 (PP˘in)    = Park Place wet pond inlet  
    PP5 (PP˘out)   = Park Place wet pond outlet  
    SC1 (SC˘in)    = South Campus storm water facility inlet  
    SC2 (SC˘outE)  = South Campus storm water facility east outlet  
    SC3 (SC˘outW)  = South Campus storm water facility west outlet  
    WL             = Grace Lane wetland (discontinued)  
 
    CW1 = Smith Creek  
    CW2 = Silver Beach Creek  
    CW3 = Park Place drain  
    CW4 = Blue Canyon Creek  
    CW5 = Anderson Creek  
    CW6 = Wildwood Creek  
    CW7 = Austin Creek  
 
 
⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆  
VERIFICATION PROCESS FOR THE LAKE WHATCOM DATA FILES  
⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆  
During the summer of 1998 the Institute for Watershed Studies began  
creating an electronic data file that would contain long term data  
records for Lake Whatcom.  These data were to be placed on a CD and  
included with annual Lake Whatcom monitoring reports.  This was the  
first attempt to make a long-term Lake Whatcom data record available  
to the public.  Because these data had been generated using different  
quality control plans over the years, a comprehensive reverification  
process was done.  
 
The reverification started with printing an copy of the entire data  
file and checking 5& of all entries against historic laboratory  
bench sheets and field notebooks.  If an error was found, the entire  
set of values for that analysis were reviewed for the sampling period  
containing the error.  Corrections were noted in the printed copy and  
entered into the electronic file; all entries were dated and initialed  
in the archive copy.  
 
Next, all data were plotted and descriptive statistics (e.g., minimum,  
maximum) were computed to identify outliers and unusual results.  All  
outliers and unusual data were verified against original bench sheets.  
A summary of decisions pertaining to these data is presented below.  
All verification actions were entered into the printed copy, dated,  
and initialed by the IWS director.  
 
The following is a partial list of the changes made to the verified  
Lake Whatcom data files.  For detailed information refer to the data  
verification archive files in the Institute for Watershed Studies  
library.  
 
Specific Deletions: 1) Rows containing only missing values were  
deleted.  2) All lab conductivity for February 1993 were deleted for  
cause: meter inadequate for low conductivity readings (borrowed  
Huxley's student meter).  3) All Hydrolab conductivity from April -  
December 1993 were deleted for cause: Hydrolab probe slowly lost  
sensitivity.  Probe was replaced and Hydrolab was reconditioned prior  
to the February 1994 sampling. 4) All 1993 Hydrolab dissolved oxygen  
data less than or equal to 2.6 mg/L were deleted for cause: Hydrolab  
probe lost sensitivity at low oxygen concentrations.  Probe was  
replaced and Hydrolab was reconditioned prior to February 1994  
sampling.  5) All srp and tp data were deleted (entered as "missing"  
in 1989) from the July 10, 1989 wq data due to sample contamination in  
at least three samples.  6) December 2, 1991, Site 3, 0 m conductivity  
point deleted due to inconsistency with adjacent points.  7) December  
15, 1993, Site 4, 80 m lab conductivity point deleted because matching  
field conductivity data are absent and point is inconsistent with all  
other lab conductivity points.  8) November 4, 1991, Site 2, 17-20 m,  
conductivity points deleted due to evidence of equipment problems  
related to depth. 9) February 2, 1990, Site 1, 20 m, soluble phosphate  
and total phosphorus points deleted due to evidence of sample  
contamination.  10) August 6, 1990, Site 1, 0 m, soluble phosphate and  
total phosphorus points deleted due to evidence of sample  
contamination.  11) October 5, 1992, Site 3, 80 m, all data deleted  
due to evidence of sample contamination in turbidity, ammonia, and  
total phosphorus results.  12) August 31, 1992, Site 3, 5 m, soluble  
phosphate and total phosphorus data deleted due to probable coding  
error.  13) All total Kjeldahl nitrogen data were removed from the  
historic record.  This was not due to errors with the data but rather  
on-going confusion over which records contained total persulfate  
nitrogen and which contained total Kjeldahl nitrogen.  The current  
historic record contains only total persulfate nitrogen.  Total  
Kjeldahl nitrogen data were retained in the IWS data base, but not in  
the long-term Lake Whatcom data files.  
 
⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆  
ROUTINE DATA VERIFICATION PROCESS  
⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆⋆  
1994-present: The Lake Whatcom data are verified using a four step  
method: 1) The results are reviewed as they are generated.  Outliers  
are checked for possible analytical or computational errors.  This  
step is completed by the Laboratory Analyst and IWS Laboratory  
Supervisor.  2) The results are reviewed monthly and sent to the City.  
Unusual results are identified.  This step is completed by the IWS  
Director.  3) The results are reviewed on an annual basis and  
discussed in the Lake Whatcom Monitoring Program Final Report.  
Unusual results are identified, and explained, if possible.  This step  
is completed by the IWS Director, IWS Laboratory Supervisor, and  
Laboratory Analyst.  4) Single-blind quality control samples,  
laboratory duplicates, and field duplicates are analyzed as specified  
in the Lake Whatcom Monitoring Program contract and in the IWS  
Laboratory Certification requirements.  Unusual results that suggest  
instrumentation or analytical problems are reported to the IWS  
Director and City.  The results from these analyses are summarized in  
the annual report.  
 
1987-1993: The lake data were reviewed as above except that the IWS  
Director's responsibilities were delegated to the Principle  
Investigator in charge of the lake monitoring contract (Dr. Robin  
Matthews).  Prior to 1991, interim reports were prepared quarterly  
rather than monthly and annual reports were descriptive rather than  
interpretive.  
 
Prior to 1987: Data were informally reviewed by the Laboratory Analyst  
and IWS Director.  Laboratory and field duplicates were commonly  
included as part of the analysis process, but no formal (i.e.,  
written) quality control program was in place.  Laboratory logs were  
maintained for most analyses, so it is possible to verify data against  
original analytical results.  It is also possible to review laboratory  
quality control results for some analyses.